A year of genomic surveillance reveals how the SARS-CoV-2 pandemic unfolded in Africa.

Authors

Wilkinson, E., Giovanetti, M., Tegally, H., San, J.E., Lessells, R., Cuadros, D., Martin, D.P., Rasmussen, D.A., Zekri, A.-R.N., Sangare, A.K., Ouedraogo, A.-S., Sesay, A.K., Priscilla, A., Kemi, A.-S., Olubusuyi, A.M., Oluwapelumi, A.O.O., Hammami, A., Amuri, A.A., Sayed, A., Ouma, A.E.O., Elargoubi, A., Ajayi, N.A., Victoria, A.F., Kazeem, A., George, A., Trotter, A.J., Yahaya, A.A., Keita, A.K., Diallo, A., Kone, A., Souissi, A., Chtourou, A., Gutierrez, A.V., Page, A.J., Vinze, A., Iranzadeh, A., Lambisia, A., Ismail, A., Rosemary, A., Sylverken, A., Femi, A., Ibrahimi, A., Marycelin, B., Oderinde, B.S., Bolajoko, B., Dhaala, B., Herring, B.L., Njanpop-Lafourcade, B.-M., Kleinhans, B., McInnis, B., Tegomoh, B., Brook, C., Pratt, C.B., Scheepers, C., Akoua-Koffi, C.G., Agoti, C.N., Peyrefitte, C., Daubenberger, C., Morang’a, C.M., Nokes, D.J., Amoako, D.G., Bugembe, D.L., Park, D., Baker, D., Doolabh, D., Ssemwanga, D., Tshiabuila, D., Bassirou, D., Amuzu, D.S.Y., Goedhals, D., Omuoyo, D.O., Maruapula, D., Foster-Nyarko, E., Lusamaki, E.K., Simulundu, E., Ong’era, E.M., Ngabana, E.N., Shumba, E., El Fahime, E., Lokilo, E., Mukantwari, E., Philomena, E., Belarbi, E., Simon-Loriere, E., Anoh, E.A., Leendertz, F., Ajili, F., Enoch, F.O., Wasfi, F., Abdelmoula, F., Mosha, F.S., Takawira, F.T., Derrar, F., Bouzid, F., Onikepe, F., Adeola, F., Muyembe, F.M., Tanser, F., Dratibi, F.A., Mbunsu, G.K., Thilliez, G., Kay, G.L., Githinji, G., van Zyl, G., Awandare, G.A., Schubert, G., Maphalala, G.P., Ranaivoson, H.C., Lemriss, H., Anise, H., Abe, H., Karray, H.H., Nansumba, H., Elgahzaly, H.A., Gumbo, H., Smeti, I., Ayed, I.B., Odia, I., Ben Boubaker, I.B., Gaaloul, I., Gazy, I., Mudau, I., Ssewanyana, I., Konstantinus, I., Lekana-Douk, J.B., Makangara, J.-C.C., Tamfum, J.-J.M., Heraud, J.-M., Shaffer, J.G., Giandhari, J., Li, J., Yasuda, J., Mends, J.Q., Kiconco, J., Morobe, J.M., Gyapong, J.O., Okolie, J.C., Kayiwa, J.T., Edwards, J.A., Gyamfi, J., Farah, J., Nakaseegu, J., Ngoi, J.M., Namulondo, J., Andeko, J.C., Lutwama, J.J., O’Grady, J., Siddle, K., Adeyemi, K.T., Tumedi, K.A., Said, K.M., Hae-Young, K., Duedu, K.O., Belyamani, L., Fki-Berrajah, L., Singh, L., Martins, L. de O., Tyers, L., Ramuth, M., Mastouri, M., Aouni, M., El Hefnawi, M., Matsheka, M.I., Kebabonye, M., Diop, M., Turki, M., Paye, M., Nyaga, M.M., Mareka, M., Damaris, M.-M., Mburu, M.W., Mpina, M., Nwando, M., Owusu, M., Wiley, M.R., Youtchou, M.T., Ayekaba, M.O., Abouelhoda, M., Seadawy, M.G., Khalifa, M.K., Sekhele, M., Ouadghiri, M., Diagne, M.M., Mwenda, M., Allam, M., Phan, M.V.T., Abid, N., Touil, N., Rujeni, N., Kharrat, N., Ismael, N., Dia, N., Mabunda, N., Hsiao, N.-Y., Silochi, N.B., Nsenga, N., Gumede, N., Mulder, N., Ndodo, N., Razanajatovo, N.H., Iguosadolo, N., Judith, O., Kingsley, O.C., Sylvanus, O., Peter, O., Femi, O., Idowu, O., Testimony, O., Chukwuma, O.E., Ogah, O.E., Onwuamah, C.K., Cyril, O., Faye, O., Tomori, O., Ondoa, P., Combe, P., Semanda, P., Oluniyi, P.E., Arnaldo, P., Quashie, P.K., Dussart, P., Bester, P.A., Mbala, P.K., Ayivor-Djanie, R., Njouom, R., Phillips, R.O., Gorman, R., Kingsley, R.A., Carr, R.A.A., El Kabbaj, S., Gargouri, S., Masmoudi, S., Sankhe, S., Lawal, S.B., Kassim, S., Trabelsi, S., Metha, S., Kammoun, S., Lemriss, S., Agwa, S.H.A., Calvignac-Spencer, S., Schaffner, S.F., Doumbia, S., Mandanda, S.M., Aryeetey, S., Ahmed, S.S., Elhamoumi, S., Andriamandimby, S., Tope, S., Lekana-Douki, S., Prosolek, S., Ouangraoua, S., Mundeke, S.A., Rudder, S., Panji, S., Pillay, S., Engelbrecht, S., Nabadda, S., Behillil, S., Budiaki, S.L., van der Werf, S., Mashe, T., Aanniz, T., Mohale, T., Le-Viet, T., Schindler, T., Anyaneji, U.J., Chinedu, U., Ramphal, U., Jessica, U., George, U., Fonseca, V., Enouf, V., Gorova, V., Roshdy, W.H., Ampofo, W.K., Preiser, W., Choga, W.T., Bediako, Y., Naidoo, Y., Butera, Y., de Laurent, Z.R., Sall, A.A., Rebai, A., von Gottberg, A., Kouriba, B., Williamson, C., Bridges, D.J., Chikwe, I., Bhiman, J.N., Mine, M., Cotten, M., Moyo, S., Gaseitsiwe, S., Saasa, N., Sabeti, P.C., Kaleebu, P., Tebeje, Y.K., Tessema, S.K., Happi, C., Nkengasong, J., de Oliveira, T.